Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem104Q3TB48 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem104Q3TB48 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms