Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACKR1Q16570 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACKR1Q16570 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms