Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPP3CAQ08209 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP3CAQ08209 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP3CAQ08209 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms