Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
NrepQ07475 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
NrepQ07475 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms