Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gdf3Q07104 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gdf3Q07104 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms