Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scg2Q03517 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scg2Q03517 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms