Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pdcd1Q02242 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pdcd1Q02242 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms