Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gfra1P97785 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gfra1P97785 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms