Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Otx1P80205 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otx1P80205 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otx1P80205 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms