Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sycp3P70281 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms