Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prrx1P63013 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prrx1P63013 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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