Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf2bP62915 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf2bP62915 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms