Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra1P62812 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra1P62812 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms