Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arf6P62331 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms