Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd2P62317 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd2P62317 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd2P62317 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snrpd2P62317 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd2P62317 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snrpd2P62317 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpd2P62317 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms