Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CckbrP56481 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms