Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GferP56213 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GferP56213 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GferP56213 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GferP56213 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GferP56213 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GferP56213 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GferP56213 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GferP56213 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms