Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn1bP46414 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cdkn1bP46414 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms