Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pik3caP42337 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pik3caP42337 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms