Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apoc1P34928 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoc1P34928 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms