Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apoc3P33622 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoc3P33622 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms