Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccnd1P25322 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccnd1P25322 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms