Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clk1P22518 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clk1P22518 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clk1P22518 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms