Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tgfb3P17125 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms