Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PolP11369 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PolP11369 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PolP11369 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PolP11369 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PolP11369 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PolP11369 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PolP11369 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PolP11369 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PolP11369 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PolP11369 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PolP11369 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PolP11369 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PolP11369 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PolP11369 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PolP11369 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms