Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Parp1P11103 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp1P11103 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms