Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dnmt3cP0DOY1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Dnmt3cP0DOY1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms