Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UbbP0CG49 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UbbP0CG49 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms