Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P04940 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P04940 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P04940 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P04940 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04940 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04940 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04940 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04940 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P04940 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P04940 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04940 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P04940 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04940 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04940 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04940 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms