Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nptx2O70340 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nptx2O70340 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms