Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gfi1bO70237 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gfi1bO70237 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms