Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atf6bO35451 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atf6bO35451 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atf6bO35451 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Atf6bO35451 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf6bO35451 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Atf6bO35451 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atf6bO35451 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atf6bO35451 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atf6bO35451 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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