Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smad6O35182 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smad6O35182 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smad6O35182 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms