Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube3aO08759 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube3aO08759 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ube3aO08759 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ube3aO08759 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Ube3aO08759 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3aO08759 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3aO08759 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3aO08759 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3aO08759 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3aO08759 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3aO08759 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ube3aO08759 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ube3aO08759 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ube3aO08759 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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