Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Taf4bG5E8Z2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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