Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm8220F6YKI2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8220F6YKI2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms