Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
UtrnE9Q6R7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UtrnE9Q6R7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms