Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm20518E9Q548 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm20518E9Q548 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms