Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm17727E9Q4V7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm17727E9Q4V7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms