Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Parp4E9PYK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Parp4E9PYK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms