Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprbB2RU80 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PtprbB2RU80 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms