Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Odf2A3KGV1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Odf2A3KGV1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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