Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CtcflA2APF3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CtcflA2APF3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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