Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fbxo47A2A6H3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fbxo47A2A6H3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms