Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm38386-201ENSMUST00000194293 3421 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Narf-201ENSMUST00000103015 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Havcr1-203ENSMUST00000109223 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Taf1-202ENSMUST00000118878 7210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 AC140449.1-201ENSMUST00000214600 1459 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Txk-202ENSMUST00000169534 2344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Liph-201ENSMUST00000060673 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Napg-201ENSMUST00000025474 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Sdcbp-204ENSMUST00000108374 1803 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Snhg12-201ENSMUST00000126380 890 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm11314-201ENSMUST00000148492 541 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm23555-201ENSMUST00000157815 135 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 2410137M14Rik-202ENSMUST00000173707 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Mir6356-201ENSMUST00000183541 102 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm12117-201ENSMUST00000183831 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm4208-201ENSMUST00000189802 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 4930474B08Rik-201ENSMUST00000194161 837 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim39Q9ESN2 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm42495-201ENSMUST00000200324 405 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Chn2-211ENSMUST00000203941 687 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim39Q9ESN2 Chn2-214ENSMUST00000204746 825 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Chn2-215ENSMUST00000204921 861 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim39Q9ESN2 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm45271-201ENSMUST00000211017 919 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 AC140409.1-201ENSMUST00000213907 457 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 AC167017.1-201ENSMUST00000214975 412 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm46197-201ENSMUST00000217530 416 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 CT009757.2-201ENSMUST00000220806 2028 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim39Q9ESN2 1700001L19Rik-202ENSMUST00000222604 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Trim39Q9ESN2 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Oat-201ENSMUST00000084500 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 A230059L01Rik-201ENSMUST00000126596 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Ubqln3-201ENSMUST00000057254 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Afp-201ENSMUST00000042755 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm4767-202ENSMUST00000188096 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gsta3-201ENSMUST00000027067 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm3286-201ENSMUST00000171752 1316 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Scel-202ENSMUST00000227322 2443 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Lrguk-201ENSMUST00000070189 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Numb-207ENSMUST00000129335 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Pwp2-201ENSMUST00000042556 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Gm7457-201ENSMUST00000100821 2459 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim39Q9ESN2 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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