Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Pnma2-202ENSMUST00000122431 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm15392-201ENSMUST00000152863 778 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Specc1l-202ENSMUST00000105421 6632 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Sltm-201ENSMUST00000049263 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Lrrc15-201ENSMUST00000064606 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Plcg2-201ENSMUST00000081232 4298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Msh4-205ENSMUST00000190449 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Acvr1-202ENSMUST00000090935 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm38249-201ENSMUST00000192560 2321 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ankrd55-201ENSMUST00000022275 2412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Tiam1-201ENSMUST00000002588 7290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm10419-204ENSMUST00000198585 4059 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Pacsin2-202ENSMUST00000165095 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Calcr-201ENSMUST00000075644 3763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Ces3a-202ENSMUST00000093223 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Map4k4-213ENSMUST00000193682 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Itgb2l-202ENSMUST00000113773 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc18Q640L5 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm43147-201ENSMUST00000196944 542 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm20670-201ENSMUST00000206468 338 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AC162934.2-201ENSMUST00000221451 249 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Gm10037-203ENSMUST00000221620 636 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Npm2-201ENSMUST00000062629 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Ctc1-201ENSMUST00000021278 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Vgll1-203ENSMUST00000114746 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 AC132392.1-202ENSMUST00000216652 2681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Myh4-202ENSMUST00000170942 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Phf21a-207ENSMUST00000111293 3900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc18Q640L5 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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