Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd2Q9Z2E1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mbd2Q9Z2E1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms