Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cldn15Q9Z0S5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Cldn15Q9Z0S5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn15Q9Z0S5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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