Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdf15Q9Z0J7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf15Q9Z0J7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms