Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pus1Q9WU56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pus1Q9WU56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms